Στη δίκη ενώπιον του Ελεγκτικού Συνεδρίου το Ελληνικό Δημόσιο εκπροσωπείται από τον Υπουργό Οικονομικών, με την επιφύλαξη ειδικότερων ρυθμίσεων, όπως η διάταξη του άρθρου 36 του ν. 4389/2016. Σύμφωνα με την τελευταία, ο Διοικητής της Α.Α.Δ.Ε. είναι το όργανο που εκπροσωπεί, αντί του Υπουργού Οικονομικών, το Δημόσιο, στις δίκες που έχουν ως αντικείμενο πράξεις ή παραλείψεις της ανεξάρτητης αυτής αρχής ή τις έννομες σχέσεις που την αφορούν.